MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Anaplasma marginale str. Gypsy Plains genome

Total Repeats: 7734

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_022784	GCCCTC	2	12	714000	714011	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
5002	NC_022784	CCA	2	6	714019	714024	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5003	NC_022784	ACA	2	6	714059	714064	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5004	NC_022784	TCCAT	2	10	714117	714126	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
5005	NC_022784	GC	3	6	714217	714222	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5006	NC_022784	CGC	2	6	714248	714253	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5007	NC_022784	N	679	679	714257	714935	0 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5008	NC_022784	TCG	2	6	714961	714966	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5009	NC_022784	TAT	2	6	715032	715037	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5010	NC_022784	TGG	2	6	715050	715055	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5011	NC_022784	GTT	2	6	715065	715070	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5012	NC_022784	TGCAGC	2	12	715074	715085	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5013	NC_022784	CT	3	6	715086	715091	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5014	NC_022784	AGT	2	6	715112	715117	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5015	NC_022784	CACC	2	8	715148	715155	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
5016	NC_022784	TCA	2	6	715207	715212	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5017	NC_022784	CAC	2	6	715383	715388	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5018	NC_022784	GCAA	2	8	715411	715418	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
5019	NC_022784	CAA	2	6	715428	715433	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5020	NC_022784	CGGCA	2	10	715467	715476	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
5021	NC_022784	ATG	2	6	715534	715539	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5022	NC_022784	AGT	2	6	715553	715558	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5023	NC_022784	CCT	2	6	715601	715606	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5024	NC_022784	CCAG	2	8	715613	715620	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
5025	NC_022784	CAGA	2	8	717630	717637	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
5026	NC_022784	TC	3	6	717688	717693	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5027	NC_022784	AGG	2	6	718541	718546	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5028	NC_022784	AGG	2	6	718609	718614	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5029	NC_022784	CA	3	6	718657	718662	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5030	NC_022784	CCA	2	6	720826	720831	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5031	NC_022784	TCAC	2	8	720844	720851	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
5032	NC_022784	CCT	2	6	725408	725413	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5033	NC_022784	CA	3	6	725529	725534	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5034	NC_022784	GGA	2	6	725566	725571	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5035	NC_022784	CAG	2	6	725608	725613	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5036	NC_022784	CGA	2	6	725625	725630	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5037	NC_022784	GA	3	6	725637	725642	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5038	NC_022784	AC	3	6	726057	726062	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5039	NC_022784	C	6	6	726100	726105	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
5040	NC_022784	CAT	2	6	726192	726197	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5041	NC_022784	CCAA	2	8	726203	726210	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5042	NC_022784	GA	3	6	726263	726268	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5043	NC_022784	CGC	2	6	726316	726321	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5044	NC_022784	N	699	699	726329	727027	0 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5045	NC_022784	TGG	2	6	727036	727041	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5046	NC_022784	CAA	2	6	727058	727063	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5047	NC_022784	GAT	2	6	727080	727085	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5048	NC_022784	ATC	2	6	727228	727233	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5049	NC_022784	GA	3	6	727280	727285	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5050	NC_022784	CTT	2	6	727366	727371	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5051	NC_022784	GTT	2	6	727468	727473	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5052	NC_022784	GGAA	2	8	727542	727549	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5053	NC_022784	GAA	2	6	727603	727608	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5054	NC_022784	GCA	2	6	727629	727634	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5055	NC_022784	CAT	2	6	727659	727664	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5056	NC_022784	GCA	2	6	727694	727699	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5057	NC_022784	AAC	2	6	727813	727818	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5058	NC_022784	AT	3	6	727836	727841	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5059	NC_022784	ACC	2	6	727860	727865	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5060	NC_022784	GTG	2	6	727873	727878	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5061	NC_022784	ACA	2	6	727888	727893	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5062	NC_022784	AAGA	2	8	727981	727988	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
5063	NC_022784	AGC	2	6	728022	728027	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5064	NC_022784	ACT	2	6	728047	728052	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5065	NC_022784	CA	4	8	728056	728063	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5066	NC_022784	CAT	2	6	728120	728125	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5067	NC_022784	CAG	2	6	728134	728139	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5068	NC_022784	TCG	2	6	728190	728195	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5069	NC_022784	TG	3	6	728275	728280	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5070	NC_022784	T	6	6	728313	728318	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5071	NC_022784	TGC	2	6	731234	731239	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5072	NC_022784	GGC	2	6	731251	731256	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5073	NC_022784	TCG	2	6	731262	731267	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5074	NC_022784	CG	3	6	731309	731314	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5075	NC_022784	TGG	2	6	732524	732529	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5076	NC_022784	AAC	2	6	734533	734538	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5077	NC_022784	GGA	2	6	734578	734583	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5078	NC_022784	AGC	2	6	734627	734632	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5079	NC_022784	ACA	2	6	734678	734683	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5080	NC_022784	CCA	2	6	735381	735386	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5081	NC_022784	CAT	2	6	735481	735486	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5082	NC_022784	CTT	2	6	735559	735564	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5083	NC_022784	GCT	2	6	735568	735573	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5084	NC_022784	TTG	2	6	735583	735588	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5085	NC_022784	ATC	2	6	735593	735598	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5086	NC_022784	CACG	2	8	735630	735637	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
5087	NC_022784	CAT	2	6	735664	735669	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5088	NC_022784	GGC	2	6	735692	735697	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5089	NC_022784	CTT	2	6	735709	735714	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5090	NC_022784	CTGC	2	8	735748	735755	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
5091	NC_022784	ATC	2	6	735764	735769	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5092	NC_022784	CTT	2	6	735844	735849	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5093	NC_022784	TTC	2	6	735911	735916	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5094	NC_022784	CTT	2	6	735947	735952	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5095	NC_022784	TCA	2	6	736089	736094	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5096	NC_022784	AAC	2	6	736112	736117	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5097	NC_022784	CCT	2	6	736243	736248	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5098	NC_022784	AGT	2	6	736274	736279	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5099	NC_022784	TCA	2	6	736392	736397	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5100	NC_022784	GTC	2	6	736524	736529	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5101	NC_022784	C	8	8	736558	736565	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
5102	NC_022784	CTC	2	6	736643	736648	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5103	NC_022784	TGG	2	6	736652	736657	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5104	NC_022784	GCT	2	6	736696	736701	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5105	NC_022784	TCC	2	6	736749	736754	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5106	NC_022784	CAT	2	6	736801	736806	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5107	NC_022784	TCA	2	6	736839	736844	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5108	NC_022784	TCC	2	6	736859	736864	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5109	NC_022784	CAT	2	6	736918	736923	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5110	NC_022784	CAA	2	6	736978	736983	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5111	NC_022784	TCTAT	2	10	737064	737073	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
5112	NC_022784	TCC	2	6	737088	737093	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5113	NC_022784	CTG	3	9	737190	737198	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5114	NC_022784	CAT	2	6	737254	737259	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5115	NC_022784	TGC	2	6	737339	737344	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5116	NC_022784	TGT	2	6	737359	737364	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5117	NC_022784	GTG	2	6	737437	737442	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5118	NC_022784	CCCA	2	8	737460	737467	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
5119	NC_022784	GT	3	6	737526	737531	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5120	NC_022784	CCA	2	6	737589	737594	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5121	NC_022784	TGG	2	6	737632	737637	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5122	NC_022784	CAA	2	6	737722	737727	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5123	NC_022784	GA	3	6	737737	737742	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5124	NC_022784	TAC	2	6	737794	737799	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5125	NC_022784	AGCA	2	8	737804	737811	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
5126	NC_022784	TGC	2	6	737823	737828	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5127	NC_022784	CCA	2	6	737860	737865	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5128	NC_022784	CTT	2	6	737906	737911	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5129	NC_022784	TGT	2	6	737926	737931	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5130	NC_022784	TGC	2	6	737937	737942	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5131	NC_022784	TGG	2	6	737998	738003	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5132	NC_022784	CTT	2	6	738062	738067	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5134	NC_022784	TC	5	10	738085	738094	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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